Αποστολή του Οικονομικού τμήματος και του Γενικού Ταμείου του Λυκείου είναι η παρακολούθηση και διαχείριση των οικονομικών στοιχείων του σωματείου, σε συνεργασία πάντα με λογιστικό γραφείο.
Η δημιουργία Εφορείας Οικονομικών, η οποία θα αναλάμβανε την εσωτερική οικονομική διοίκηση και διαχείριση των εσόδων και εξόδων, προβλεπόταν ήδη από το 1911. Επίσης στο ιδρυτικό καταστατικό η Γενική Ταμίας ορίζεται αρμόδια «δια την ακριβολόγον του ταμείου λειτουργία» και «την διαχειριστικήν υπηρεσίαν των εορτών».
Πρώτη Έφορος Οικονομικών υπήρξε η Ευανθία Εμπεδοκλή και ο πρώτος ισολογισμός του Λυκείου έγινε το 1912. Την πρώτη Έφορο διαδέχθηκαν οι Δέσποινα Βλαστού, Ελένη Αραβαντινού, Ελένη Σαουνάτσου, Γεωργία Θαλασσινού, Άννα Κριτσέλη, Ελένη Νέζου και Θούλα Βαλάτα. Σήμερα Έφορος είναι η Μαριλένα Κουκουλίθρα.
Αντίστοιχα, πρώτη Γενική Ταμίας υπήρξε η Ειρήνη Καλογερή, την οποία διαδέχθηκαν οι Ελένη Καλλιφρονά, Μαρία Σουλιώτου Φωφώ Καλλιανέση, Ελένη Καζαμία, Αντιγόνη Ρηγινού και Μαρία Παπαμάρκου. Γενική Ταμίας σήμερα η Κατερίνα Πολυδώρου-Χαρατσή.
