Αποστολή του Οικονομικού τμήματος και του Γενικού Ταμείου του Λυκείου είναι η παρακολούθηση και διαχείριση των οικονομικών στοιχείων του σωματείου, σε συνεργασία πάντα με λογιστικό γραφείο.
Η δημιουργία Εφορείας Οικονομικών, η οποία θα αναλάμβανε την εσωτερική οικονομική διοίκηση και διαχείριση των εσόδων και εξόδων, προβλεπόταν ήδη από το 1911. Επίσης στο ιδρυτικό καταστατικό η Γενική Ταμίας ορίζεται αρμόδια «δια την ακριβολόγον του ταμείου λειτουργία» και «την διαχειριστικήν υπηρεσίαν των εορτών».
Πρώτη Έφορος Οικονομικών υπήρξε η Ευανθία Εμπεδοκλή και ο πρώτος ισολογισμός του Λυκείου έγινε το 1912. Την πρώτη Έφορο διαδέχθηκαν οι Δέσποινα Βλαστού, Ελένη Αραβαντινού, Ελένη Σαουνάτσου, Γεωργία Θαλασσινού, Άννα Κριτσέλη, Ελένη Νέζου, Θούλα Βαλάτα, Μαριλένα Κουκουλίθρα και Εύη Καρασαββίδου. Έφορος σήμερα είναι η Λεμονιά Παμφίλη.
Αντίστοιχα, πρώτη Γενική Ταμίας υπήρξε η Ειρήνη Καλογερή, την οποία διαδέχθηκαν οι Ελένη Καλλιφρονά, Μαρία Σουλιώτου Φωφώ Καλλιανέση, Ελένη Καζαμία, Αντιγόνη Ρηγινού και Μαρία Παπαμάρκου. Γενική Ταμίας σήμερα η Κατερίνα Πολυδώρου-Χαρατσή.
